Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms