Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYPL1Q16563 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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