Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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EXT1Q16394 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EXT1Q16394 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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