Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
E2F4Q16254 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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