Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC85BQ15834 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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