Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNA6Q15825 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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