Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRCAPQ14761 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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