Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP1A4Q13733 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms