Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4BQ13620 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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