Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CUL1Q13616 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms