Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PSMA6-205ENST00000554457 4730 nt8.67□□□□□ -1.022e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.192e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.392e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMA6-213ENST00000556221 423 ntTSL 34.45□□□□□ -1.72e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.212e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.682e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMB5-206ENST00000555895 444 ntTSL 317.39■□□□□ 0.372e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 RPL27-202ENST00000586277 460 ntTSL 39.79□□□□□ -0.844e-36■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.532e-15■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.782e-15■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.652e-15■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.417e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.428e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.98e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.88e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PTTG1-204ENST00000519287 670 ntTSL 59.07□□□□□ -0.968e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PRELID1-202ENST00000502670 587 ntTSL 326.89■■□□□ 1.96e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.684e-16■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.64e-16■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 RPS2-213ENST00000533161 1186 ntTSL 1 (best)29.35■■■□□ 2.294e-16■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.252e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 219.01■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 TIMM50-208ENST00000597552 369 ntTSL 212.04□□□□□ -0.481e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.971e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.191e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NAPA-215ENST00000597271 1467 ntTSL 222.21■■□□□ 1.151e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NAPA-205ENST00000594001 1417 ntTSL 220.28■□□□□ 0.841e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.081e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NAPA-217ENST00000597778 3898 ntTSL 212.55□□□□□ -0.41e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NAPA-207ENST00000594217 554 ntTSL 511.86□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.986e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.636e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 C10orf128-204ENST00000374156 2070 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.255e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 C10orf128-203ENST00000374153 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.075e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 C10orf128-202ENST00000374151 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.335e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PPAT-201ENST00000264220 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.393e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PPAT-202ENST00000425339 4043 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.383e-9■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.874e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PKM-214ENST00000565143 2301 ntTSL 1 (best)14.04□□□□□ -0.162e-13■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.772e-13■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 LYRM4-209ENST00000606472 1005 ntTSL 210.78□□□□□ -0.687e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MAD2L2-202ENST00000376655 1095 ntTSL 222.93■■□□□ 1.262e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.725e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ALDH16A1-204ENST00000593417 2343 ntTSL 224.81■■□□□ 1.565e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.295e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ALDH16A1-205ENST00000594549 681 ntTSL 222.26■■□□□ 1.155e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.695e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.685e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 ALDH16A1-207ENST00000599652 3995 ntTSL 215.81■□□□□ 0.125e-7■■□□□ 14.1
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PABPC4Q13310 RARS-204ENST00000520013 1990 ntTSL 28.29□□□□□ -1.085e-8■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 GET4-206ENST00000464468 676 ntTSL 320.93■□□□□ 0.944e-7■■□□□ 14.1
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PABPC4Q13310 PSMB2-201ENST00000373237 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMB2-203ENST00000630477 1127 ntTSL 1 (best)12.75□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 MRPS36-203ENST00000507022 298 ntTSL 38.96□□□□□ -0.985e-7■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 525.29■■□□□ 1.646e-19■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 RHOC-217ENST00000527563 579 ntTSL 320.74■□□□□ 0.911e-11■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-6■■□□□ 14.1
PABPC4Q13310 SSR4-207ENST00000471724 443 ntTSL 316.49■□□□□ 0.231e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.475e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.65e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)10.95□□□□□ -0.665e-14■■□□□ 14
PABPC4Q13310 CTSZ-204ENST00000503833 955 ntTSL 1 (best)26.73■■□□□ 1.879e-10■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BID-208ENST00000550946 1394 ntTSL 1 (best)22.64■■□□□ 1.229e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.149e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 TRMT2A-218ENST00000492988 854 ntTSL 520.52■□□□□ 0.882e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 NHP2-205ENST00000511078 475 ntTSL 220.11■□□□□ 0.818e-48■■□□□ 14
PABPC4Q13310 NHP2-206ENST00000514354 472 ntTSL 317.95■□□□□ 0.468e-48■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.29e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SSR1-205ENST00000475213 446 ntTSL 314.8□□□□□ -0.049e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.089e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 NHP2-203ENST00000502263 552 ntTSL 211.43□□□□□ -0.588e-48■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.099e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.539e-13■■□□□ 14
PABPC4Q13310 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.36e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.036e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.833e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PABPC4-205ENST00000421687 1663 ntTSL 516.35■□□□□ 0.216e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RHOBTB3-214ENST00000513091 591 ntTSL 315.21■□□□□ 0.036e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 ARNT-204ENST00000471844 3703 ntTSL 214.51□□□□□ -0.093e-6■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PFKFB2-203ENST00000411990 1876 ntTSL 29.96□□□□□ -0.826e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PFKFB2-206ENST00000473310 892 ntTSL 26.51□□□□□ -1.376e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.426e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.426e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PAXX-202ENST00000463765 496 ntTSL 220.36■□□□□ 0.854e-9■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 516.65■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.132e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 GSE1-207ENST00000469381 5885 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-17■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RPL34-204ENST00000502534 560 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-17■■□□□ 14
PABPC4Q13310 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.072e-17■■□□□ 14
PABPC4Q13310 VPS4A-204ENST00000566354 2329 ntTSL 1 (best)14.33□□□□□ -0.129e-8■■□□□ 14
PABPC4Q13310 PDCD2-210ENST00000543284 3255 ntTSL 24.24□□□□□ -1.733e-7■■□□□ 14
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