RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514354.5

NHP2-206, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene NHP2, Length 472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-206ENST00000514354 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.57■■■■□ 3.44
NHP2-206ENST00000514354 ABCC9O60706 1549 aa33.09■■■□□ 2.89
NHP2-206ENST00000514354 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.77■■■□□ 2.84
NHP2-206ENST00000514354 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.36■■■□□ 2.61
NHP2-206ENST00000514354 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.23■■■□□ 2.59
NHP2-206ENST00000514354 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.14■■■□□ 2.58
NHP2-206ENST00000514354 NACADO15069 1562 aa31.11■■■□□ 2.57
NHP2-206ENST00000514354 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.87■■■□□ 2.53
NHP2-206ENST00000514354 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.62■■■□□ 2.49
NHP2-206ENST00000514354 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.48■■■□□ 2.47
NHP2-206ENST00000514354 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.42■■■□□ 2.46
NHP2-206ENST00000514354 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
NHP2-206ENST00000514354 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.17■■■□□ 2.42
NHP2-206ENST00000514354 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.01■■■□□ 2.4
NHP2-206ENST00000514354 SCRIBQ14160 1630 aa29.93■■■□□ 2.38
NHP2-206ENST00000514354 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.82■■■□□ 2.36
NHP2-206ENST00000514354 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.81■■■□□ 2.36
NHP2-206ENST00000514354 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
NHP2-206ENST00000514354 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.81■■■□□ 2.2
NHP2-206ENST00000514354 NCAPD3P42695 1498 aa28.77■■■□□ 2.2
NHP2-206ENST00000514354 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.66■■■□□ 2.18
NHP2-206ENST00000514354 ERCC6Q03468 1493 aa28.61■■■□□ 2.17
NHP2-206ENST00000514354 CUX2O14529 1486 aa28.56■■■□□ 2.16
NHP2-206ENST00000514354 SMARCA2P51531 1590 aa28.53■■■□□ 2.16
NHP2-206ENST00000514354 SMARCA4P51532 1647 aa28.51■■■□□ 2.15
NHP2-206ENST00000514354 HMGXB3Q12766 1538 aa28.48■■■□□ 2.15
NHP2-206ENST00000514354 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
NHP2-206ENST00000514354 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
NHP2-206ENST00000514354 NESP48681 1621 aa28.36■■■□□ 2.13
NHP2-206ENST00000514354 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.23■■■□□ 2.11
NHP2-206ENST00000514354 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.19■■■□□ 2.1
NHP2-206ENST00000514354 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.09■■■□□ 2.09
NHP2-206ENST00000514354 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.02■■■□□ 2.08
NHP2-206ENST00000514354 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
NHP2-206ENST00000514354 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.93■■■□□ 2.06
NHP2-206ENST00000514354 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.87■■■□□ 2.05
NHP2-206ENST00000514354 WIZO95785 1651 aa27.78■■■□□ 2.04
NHP2-206ENST00000514354 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.75■■■□□ 2.03
NHP2-206ENST00000514354 WDR62O43379 1518 aa27.64■■■□□ 2.02
NHP2-206ENST00000514354 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.61■■■□□ 2.01
NHP2-206ENST00000514354 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
NHP2-206ENST00000514354 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.58■■■□□ 2.01
NHP2-206ENST00000514354 CFTRP13569 1480 aa27.53■■■□□ 2
NHP2-206ENST00000514354 TRIM41Q8WV44 630 aa27.53■■■□□ 2
NHP2-206ENST00000514354 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
NHP2-206ENST00000514354 OSCARQ8IYS5 282 aa27.34■■□□□ 1.97
NHP2-206ENST00000514354 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
NHP2-206ENST00000514354 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.19■■□□□ 1.94
NHP2-206ENST00000514354 IFT140Q96RY7 1462 aa27.07■■□□□ 1.92
NHP2-206ENST00000514354 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
NHP2-206ENST00000514354 PRDM2Q13029 1718 aa27.02■■□□□ 1.92
NHP2-206ENST00000514354 TOPBP1Q92547 1522 aa27.01■■□□□ 1.91
NHP2-206ENST00000514354 ABCC8Q09428 1581 aa26.96■■□□□ 1.91
NHP2-206ENST00000514354 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.87■■□□□ 1.89
NHP2-206ENST00000514354 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.83■■□□□ 1.89
NHP2-206ENST00000514354 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.83■■□□□ 1.89
NHP2-206ENST00000514354 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.83■■□□□ 1.89
NHP2-206ENST00000514354 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.887e-6■■□□□ 13.1
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NHP2-206ENST00000514354 ARHGEF11O15085 1522 aa26.79■■□□□ 1.88
NHP2-206ENST00000514354 FBLN2P98095 1184 aa26.76■■□□□ 1.87
NHP2-206ENST00000514354 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
NHP2-206ENST00000514354 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
NHP2-206ENST00000514354 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.73■■□□□ 1.87
NHP2-206ENST00000514354 SOGA1O94964 1423 aa26.67■■□□□ 1.86
NHP2-206ENST00000514354 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.67■■□□□ 1.86
NHP2-206ENST00000514354 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
NHP2-206ENST00000514354 CHD1O14646 1710 aa26.59■■□□□ 1.85
NHP2-206ENST00000514354 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.55■■□□□ 1.84
NHP2-206ENST00000514354 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NHP2-206ENST00000514354 ARAP1Q96P48 1450 aa26.51■■□□□ 1.83
NHP2-206ENST00000514354 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.5■■□□□ 1.83
NHP2-206ENST00000514354 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
NHP2-206ENST00000514354 CUX1P39880 1505 aa26.48■■□□□ 1.83
NHP2-206ENST00000514354 WDR97A6NE52 1622 aa26.43■■□□□ 1.82
NHP2-206ENST00000514354 GRIN2BQ13224 1484 aa26.42■■□□□ 1.82
NHP2-206ENST00000514354 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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NHP2-206ENST00000514354 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.34■■□□□ 1.81
NHP2-206ENST00000514354 SYNJ1O43426 1573 aa26.34■■□□□ 1.81
NHP2-206ENST00000514354 SYNJ2O15056 1496 aa26.34■■□□□ 1.81
NHP2-206ENST00000514354 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.31■■□□□ 1.8
NHP2-206ENST00000514354 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.23■■□□□ 1.79
NHP2-206ENST00000514354 PBRM1Q86U86 1689 aa26.15■■□□□ 1.78
NHP2-206ENST00000514354 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
NHP2-206ENST00000514354 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.14■■□□□ 1.77
NHP2-206ENST00000514354 GRIN2AQ12879 1464 aa26.06■■□□□ 1.76
NHP2-206ENST00000514354 NUP160Q12769 1436 aa25.98■■□□□ 1.75
NHP2-206ENST00000514354 TOP2BQ02880 1626 aa25.98■■□□□ 1.75
NHP2-206ENST00000514354 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.97■■□□□ 1.75
NHP2-206ENST00000514354 ADAMTS12P58397 1594 aa25.96■■□□□ 1.75
NHP2-206ENST00000514354 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.95■■□□□ 1.74
NHP2-206ENST00000514354 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.94■■□□□ 1.74
NHP2-206ENST00000514354 CEP170Q5SW79 1584 aa25.94■■□□□ 1.74
NHP2-206ENST00000514354 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.88■■□□□ 1.73
NHP2-206ENST00000514354 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
NHP2-206ENST00000514354 JPH4Q96JJ6 628 aa25.81■■□□□ 1.72
NHP2-206ENST00000514354 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
NHP2-206ENST00000514354 SHROOM2Q13796 1616 aa25.79■■□□□ 1.72
NHP2-206ENST00000514354 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
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