Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF5Q13243 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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