Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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NME3Q13232 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NME3Q13232 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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NME3Q13232 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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NME3Q13232 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NME3Q13232 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NME3Q13232 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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