Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRDM2Q13029 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRDM2Q13029 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
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