Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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FOXF1Q12946 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXF1Q12946 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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