Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BPTFQ12830 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BPTFQ12830 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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