Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMARCB1Q12824 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
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