Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TWF1Q12792 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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