Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C2orf54Q08AI8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1019.2 ms