Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACSM1Q08AH1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms