Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC008040.1-204ENST00000469301 1738 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP2Q05952 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms