Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPCQ03188 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms