Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POU3F1Q03052 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms