Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms