Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSC2Q02487 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms