Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FLI1Q01543 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms