Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F1Q01094 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F1Q01094 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms