Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDK16Q00536 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms