Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2BQ00403 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms