Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBB4BP68371 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TUBB4BP68371 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms