Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HERVK_113P63121 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms