Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NP61088 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NP61088 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2NP61088 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2NP61088 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2NP61088 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2NP61088 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms