Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIPK4P57078 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms