Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBX2P52951 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GBX2P52951 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX2P52951 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX2P52951 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GBX2P52951 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms