Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPAP49450 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms