Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PBX2P40425 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBX2P40425 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBX2P40425 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBX2P40425 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBX2P40425 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBX2P40425 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBX2P40425 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBX2P40425 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PBX2P40425 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PBX2P40425 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PBX2P40425 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms