Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms