Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTN2P35609 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms