Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms