Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OTX2P32243 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms