Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKLRP30613 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKLRP30613 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms