Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2E1P29083 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms