Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms