Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PLNP26678 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PLNP26678 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PLNP26678 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PLNP26678 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PLNP26678 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PLNP26678 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms