Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPREP23469 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPREP23469 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PTPREP23469 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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PTPREP23469 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPREP23469 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPREP23469 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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