Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPEP16870 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CPEP16870 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPEP16870 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPEP16870 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPEP16870 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPEP16870 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPEP16870 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms