Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CREB1P16220 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CREB1P16220 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CREB1P16220 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CREB1P16220 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms