Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF35P13682 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms