Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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